Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms