Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Rnf19bA2A7Q9 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf19bA2A7Q9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf19bA2A7Q9 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf19bA2A7Q9 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf19bA2A7Q9 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf19bA2A7Q9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf19bA2A7Q9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf19bA2A7Q9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf19bA2A7Q9 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf19bA2A7Q9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf19bA2A7Q9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf19bA2A7Q9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf19bA2A7Q9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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