Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm3550W4VSN7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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