Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms