Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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