Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.7 ms