Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms