Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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