Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms