Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Tnnt3Q9QZ47 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Tnnt3Q9QZ47 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms