Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hacd1Q9QY80 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hacd1Q9QY80 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms