Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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