Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms