Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms