Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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