Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmgn3Q9DCB1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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