Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf6Q9DBU5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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