Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Smg9Q9DB90 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Smg9Q9DB90 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Smg9Q9DB90 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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