Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms