Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms