Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Snx29Q9D3S3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Snx29Q9D3S3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Snx29Q9D3S3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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