Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem53Q9D0Z3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms