Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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