Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CWU4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CWU4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms