Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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