Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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