Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms