Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms