Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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