Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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