Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp16Q99LG0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp16Q99LG0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp16Q99LG0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp16Q99LG0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp16Q99LG0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp16Q99LG0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp16Q99LG0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp16Q99LG0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp16Q99LG0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp16Q99LG0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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