Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms