Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Krcc1Q99JT5 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Krcc1Q99JT5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Krcc1Q99JT5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Krcc1Q99JT5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Krcc1Q99JT5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Krcc1Q99JT5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Krcc1Q99JT5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Krcc1Q99JT5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Krcc1Q99JT5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Krcc1Q99JT5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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