Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms