Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY5

Pcdhga3, Protocadherin gamma A3, mousemouse

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga3Q91XY5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pcdhga3Q91XY5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pcdhga3Q91XY5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pcdhga3Q91XY5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pcdhga3Q91XY5 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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