Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEH2

Ciz1, CDKN1A-interacting zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciz1Q8VEH2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciz1Q8VEH2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms