Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Smg8Q8VE18 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Smg8Q8VE18 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Smg8Q8VE18 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms