Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms