Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms