Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Depp1Q8K2F3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Depp1Q8K2F3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Depp1Q8K2F3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Depp1Q8K2F3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Depp1Q8K2F3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Depp1Q8K2F3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Depp1Q8K2F3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Depp1Q8K2F3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Depp1Q8K2F3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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