Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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