Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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FgbQ8K0E8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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