Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms