Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfcQ8CI19 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfcQ8CI19 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms