Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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