Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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