Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms