Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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