Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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