Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Negr1Q80Z24 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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